รางวัลภายในประเทศ

• พ.ศ. 2534 - รางวัลนักวิทยาศาสตร์รุ่นใหม่ สาขาชีววิทยาโมเลกุล จากมูลนิธิส่งเสริมวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีในพระบรมราชูปถัมภ์
• พ.ศ. 2537-2540 - เมธีวิจัย สกว. รุ่นที่ 1 สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย (สกว.)
• พ.ศ. 2539–2544 - รางวัลพัฒนาวิชาชีพนักวิจัย สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ (สวทช.)
• พ.ศ. 2540 - รางวัลสภาวิจัยแห่งชาติ รางวัลผลงานวิจัยดีเยี่ยม สาขาวิทยาศาสตร์เคมีและเภสัช จากผลงานวิจัยเรื่อง "ยีนสังเคราะห์ไดไฮโดรโฟเลต รีดักเทส เพื่อการศึกษากลไกการดื้อยาแอนตี้โฟเลต ในเชื้อมาลาเรียฟัลซิปารั่ม"
• พ.ศ. 2541 - รางวัลมหาวิทยาลัยมหิดล สาขาการวิจัย จากมหาวิทยาลัยมหิดล
• พ.ศ. 2547 - รางวัลศิษย์เก่าดีเด่น บัณฑิตวิทยาลัย มหาวิทยาลัยมหิดล

รางวัลจากต่างประเทศ

• พ.ศ. 2531–2535 - รางวัล L.W. Frohlich Research Award จาก The New York Academy of Science ประเทศสหรัฐอเมริกา
• พ.ศ. 2535 - รางวัล Career Development Award จากมูลนิธิร็อคกี้เฟลเลอร์